อินโดลีนถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่ระบบประสาทส่วนกลาง มันทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีคุณสมบัติต้านอาการซึมเศร้า ต้านไซโคติก และต้านความดันโลหิตสูง นอกจากนี้ สารอนุพันธ์ของอินโดลีนยังถูกนำมาใช้ในสารเคมีเกษตรสำหรับการสร้างยาฆ่าแมลงและวัชอุขาต่างๆ เนื่องจากมีกิจกรรมทางชีวภาพ ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ สีย้อมที่อิงจากอินโดลีนถูกนำมาใช้ในโฟโตโวลตาอิกแบบอินทรีย์และเซลล์สุริยะที่ sensitized ด้วยสีย้อม เพื่อเพิ่มการดูดซับแสงและประสิทธิภาพการแปลงพลังงาน โครงสร้างที่หลากหลายของมันยังทำให้มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน