อินโดลิน-5-ออล ไฮโดรคลอไรด์ ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพทางรักษา มันทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตโมเลกุลที่ใช้งานทางชีวภาพต่างๆ รวมถึงสารที่เล็งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและมะเร็ง คุณสมบัติโครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะเจาะจง ซึ่งช่วยในการค้นพบยาใหม่ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษเคมีอินทรีย์เพื่อสำรวจเส้นทางปฏิกิริยาใหม่และพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ที่มีประสิทธิภาพ การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปสู่สาขาเคมียารักษา ซึ่งช่วยในการปรับปรุงผู้สมัครยาเพื่อประสิทธิภาพและความปลอดภัยที่ดียิ่งขึ้น