7-Nitroindoline hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนายาเภสัชหลายชนิด กลุ่มไนโตรของมันทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าในการสังเคราะห์อนุพันธ์อินโดล ซึ่งมีความสำคัญในการสร้างยาที่มีศักยภาพในการบำบัด นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาปฏิกิริยาเคมีที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้างอินโดล ช่วยในการค้นพบโมเลกุลชีวภาพใหม่ๆ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่สาขาเคมียารักษาโรค ซึ่งช่วยในการออกแบบและปรับปรุงยาที่มุ่งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะเจาะจง