6-Fluoro-1-methylindolin-2-one มีการประยุกต์ใช้ในสาขาเคมีทางการแพทย์ โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบทางเภสัชกรรม สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย นักวิจัยนำสารประกอบนี้มาใช้ในการสร้างผู้สมัครยาที่มีศักยภาพสำหรับโรคทางระบบประสาท เช่น โรคพาร์กินสันและภาวะซึมเศร้า เนื่องจากโครงสร้างของมันมีความคล้ายคลึงกับอนุพันธ์ของอินโดล ซึ่งเป็นที่ทราบกันดีว่าสามารถโต้ตอบกับระบบสารสื่อประสาท นอกจากนี้ ยังมีการสำรวจในการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาการรักษาสำหรับภาวะต่าง ๆ เช่น มะเร็งและการอักเสบ การแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับตัว ทำให้เป็นโครงสร้างพื้นฐานที่มีคุณค่าสำหรับกระบวนการค้นพบและปรับปรุงยา