ไอโอดีนถูกใช้อย่างแพร่หลายในด้านการแพทย์และสาธารณสุข โดยเฉพาะในการฆ่าเชื้อโรคและทำความสะอาดบาดแผล เนื่องจากมีคุณสมบัติในการทำลายแบคทีเรีย ไวรัส และเชื้อรา นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตน้ำดื่มเพื่อฆ่าเชื้อโรค และเป็นส่วนประกอบในยาบางชนิด เช่น ยาแก้ไอและยาทาภายนอกสำหรับรักษาโรคผิวหนังบางชนิด ในด้านอุตสาหกรรมอาหาร ไอโอดีนถูกใช้เป็นสารเติมแต่งในเกลือเสริมไอโอดีน เพื่อป้องกันโรคขาดไอโอดีนซึ่งอาจนำไปสู่ปัญหาสุขภาพ เช่น โรคคอพอก นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการผลิตอาหารสัตว์เพื่อเสริมไอโอดีนในอาหารสัตว์ ในทางวิทยาศาสตร์ ไอโอดีนใช้เป็นสารทดสอบในปฏิกิริยาเคมีหลายชนิด เช่น การทดสอบแป้ง โดยเมื่อไอโอดีนทำปฏิกิริยากับแป้งจะเกิดสีน้ำเงินเข้มซึ่งช่วยในการตรวจสอบได้อย่างชัดเจน นอกจากนี้ ไอโอดีนยังถูกใช้ในกระบวนการผลิตสารเคมีอื่นๆ เช่น สารประกอบไอโอดีนที่ใช้ในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์และอุตสาหกรรมยา