ไอโอดีนเพนทอกไซด์ถูกใช้เป็นสารออกซิไดซ์ที่แรงในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์อินทรีย์ มีประสิทธิภาพในการแปลงแอลกอฮอล์เป็นอัลดีไฮด์หรือคีโตน

นำไปใช้ในเคมีวิเคราะห์สำหรับการกำหนดระดับคาร์บอนมอนอกไซด์ โดยทำปฏิกิริยากับ CO เพื่อผลิตไอโอดีน ซึ่งสามารถวัดได้

นำไปใช้ในการเตรียมสารประกอบที่มีไอโอดีนและเป็นสารดูดความชื้นในปฏิกิริยาบางชนิด

ยังถูกนำไปใช้ในกระบวนการวิจัยและอุตสาหกรรมที่ต้องการการออกซิเดชันที่ควบคุม

จัดการด้วยความระมัดระวังเนื่องจากความตอบสนองและอันตรายที่อาจเกิดขึ้น