ไอโอโดอีเทนถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารอัลไคเลติ้งเอเจนต์ในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยนำกลุ่มเอทิลเข้าสู่สารประกอบต่างๆ มีประโยชน์โดยเฉพาะในการเตรียมอนุพันธ์เอทิลของแอลกอฮอล์ อะมีน และไทออล ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นรีเอเจนต์สำหรับการสังเคราะห์ส่วนประกอบเภสัชกรรมที่ใช้งานได้ (APIs) และอินเทอร์มีเดียต นอกจากนี้ ไอโอโดอีเทนยังถูกใช้ในการผลิตเอทิลอีเทอร์และเอสเตอร์ ซึ่งจำเป็นในการพัฒนารสชาติ กลิ่นหอม และตัวทำละลาย ความตอบสนองของมันในปฏิกิริยาการแทนที่นิวคลีโอฟิลิกทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยในห้องปฏิบัติการสำหรับการศึกษากลไกปฏิกิริยาและการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน