อินโด-1 AM ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีววิทยาและวิทยาศาสตร์การแพทย์เพื่อวัดระดับแคลเซียมภายในเซลล์ เนื่องจากสารนี้สามารถแทรกซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์และถูกเปลี่ยนเป็นอินโด-1 ซึ่งเป็นรูปแบบที่สามารถจับกับแคลเซียมได้ เมื่ออินโด-1 จับกับแคลเซียม จะเกิดการเปลี่ยนแปลงของสเปกตรัมการเรืองแสง ทำให้สามารถวัดปริมาณแคลเซียมภายในเซลล์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ อินโด-1 AM ยังถูกใช้ในการศึกษากระบวนการทางเซลล์ต่าง ๆ เช่น การส่งสัญญาณภายในเซลล์ การทำงานของช่องทางแคลเซียม และการตอบสนองของเซลล์ต่อสิ่งเร้าต่าง ๆ การใช้งานนี้มีความสำคัญในการวิจัยโรคที่เกี่ยวข้องกับความผิดปกติของระดับแคลเซียมในเซลล์ เช่น โรคหัวใจ โรคทางระบบประสาท และโรคมะเร็ง ด้วยคุณสมบัติที่ไวต่อการเปลี่ยนแปลงของแคลเซียม อินโด-1 AM จึงเป็นเครื่องมือที่มีค่าสำหรับนักวิจัยในการทำความเข้าใจกลไกทางชีววิทยาที่ซับซ้อนและพัฒนาวิธีการรักษาใหม่ ๆ