Ethyl isocyanatoacetate ใช้เป็นหลักในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่าง ๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตร เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารออกฤทธิ์สำหรับยา เช่น ยาปฏิชีวนะและยาต้านการอักเสบ นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าแมลง เพื่อการป้องกันพืชและเพิ่มผลผลิตทางการเกษตร ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ ใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์และสารเคลือบผิว เพื่อเพิ่มความทนทานและประสิทธิภาพ การตอบสนองทางเคมีกับอะมีนและแอลกอฮอล์ทำให้มีคุณค่าในการสร้างกาวและยาปิดผนึกรอยที่มีคุณสมบัติการยึดติดที่ดีขึ้น