1-(isoquinolin-5-yl)ethanone ถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ มันเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสร้างโมเลกุลที่มีโครงสร้าง isoquinoline ซึ่งพบได้ในหลายยาชนิด เช่น ยาต้านมะเร็ง ยาต้านการอักเสบ และยาต้านจุลชีพ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนาสารใหม่ๆ ที่มีศักยภาพในการรักษาโรคต่างๆ รวมถึงการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อสร้างสารเคมีเฉพาะทางที่มีมูลค่าสูงอีกด้วย