5-Bromo-3-methyl-8-nitroisoquinoline ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างเฉพาะตัวของมันทำให้มีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบใหม่ที่มีฤทธิ์ทางยา นอกจากนี้ยังมีการศึกษาเพื่อประยุกต์ใช้ในกระบวนการทางเคมีอินทรีย์ เช่น การสร้างสารเชิงซ้อนหรือการปรับเปลี่ยนโครงสร้างโมเลกุลเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการออกฤทธิ์ งานวิจัยบางส่วนยังชี้ให้เห็นถึงความเป็นไปได้ในการนำไปใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็งหรือสารต้านจุลชีพ เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่สามารถยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์หรือเชื้อโรคได้