ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านปรสิตและยาต้านจุลชีพ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในเคมีทางการแพทย์สำหรับการปรับปรุงประสิทธิภาพของยาและเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่ขึ้นอยู่กับไอโซควินโอลีนซึ่งมีศักยภาพในการรักษาโรคติดเชื้อ