ใช้เป็นสาร derivatization ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะในการตรวจจับและวัดปริมาณแอมีนและกรดอะมิโน หมู่ไอโซไทโอไซยาเนตทำปฏิกิริยาแบบเลือกสรรกับแอมีนปฐมภูมิเพื่อสร้างอนุพันธ์ thiourea ที่เสถียร ซึ่งง่ายต่อการวิเคราะห์ด้วยเทคนิคเช่น HPLC หรือ GC-MS การมีอะตอมโบรมีนช่วยเพิ่มการตรวจจับได้ในสเปกโตรเมตรีมวล และช่วยในการตกผลึกสำหรับการศึกษาโครงสร้าง นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบ heterocyclic และสารกลางทางเภสัชกรรมที่ต้องการโครง aromatic ที่มีโบรมีน ความสามารถในการทำปฏิกิริยาและการติดฉลากทำให้มีประโยชน์ในงานทดสอบทางชีวเคมีและการพัฒนาโปรบฟลูออเรสเซนต์เมื่อจับคู่กับโมเลกุล reporter ที่เหมาะสม