Propyl isothiocyanate ถูกใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเกษตรกรรมเป็นยาฆ่าแมลงจากธรรมชาติ เนื่องจากมีคุณสมบัติในการไล่และควบคุมศัตรูพืช มีประสิทธิภาพต่อแมลงและไนมาโตดหลากหลายชนิด ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในแนวทางการทำเกษตรอินทรีย์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในอุตสาหกรรมอาหารเป็นสารแต่งกลิ่นและรส สร้างรสชาติฉุนคล้ายมัสตาร์ดให้กับผลิตภัณฑ์ต่างๆ เช่น ซอส เครื่องเทศ และเครื่องปรุงรส ในด้านการวิจัย Propyl isothiocyanate ทำหน้าที่เป็นเครื่องมือทางชีวเคมีในการศึกษาผลกระทบของไอโซไธโอไซยาเนตต่อกระบวนการในเซลล์ โดยเฉพาะในการวิจัยมะเร็ง ซึ่งสำรวจศักยภาพในการต้านมะเร็ง รวมถึงฤทธิ์ต้านอนุมูลอิสระที่อาจช่วยยับยั้งการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็ง นอกจากนี้ คุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ที่แข็งแกร่งยังช่วยในการถนอมอาหารและป้องกันการเน่าเสีย