2-(Methoxy-d3)-aniline มักใช้ในการวิจัยทางเคมีและชีวเคมี โดยเฉพาะในด้านการสังเคราะห์สารและวิเคราะห์ทางเภสัชวิทยา เป็นสารที่นิยมใช้ในการติดฉลากไอโซโทปเพื่อติดตามปฏิกิริยาเคมีหรือกระบวนการทางชีวภาพ ช่วยให้สามารถศึกษาเส้นทางการเผาผลาญหรือกลไกการทำงานของยาได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ยังอาจใช้ในการพัฒนายาและสารเคมีที่มีความจำเพาะสูง เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงในการรักษาโรค กลุ่มเมทอกซี-d3 ที่ถูก deuterated ทำให้มีคุณค่าสำคัญในการสเปกโทรสโกปี NMR ซึ่งช่วยในการวิเคราะห์โครงสร้างโมเลกุล