Acetamidine-d3 hydrochloride ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนา โดยเฉพาะในสาขาชีวเคมีและเภสัชวิทยา ทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์แบบ deuterated ของ acetamidine ทำให้มีคุณค่าสำคัญในการศึกษาการติดฉลากไอโซโทป สารประกอบนี้มักใช้ใน mass spectrometry และ NMR spectroscopy เพื่อติดตามและวิเคราะห์เส้นทางการเมแทบอลิซึมและกลไกการออกฤทธิ์ของยา อะตอมเดยูเทรียมช่วยเพิ่มความแม่นยำของเทคนิคการวิเคราะห์เหล่านี้ ทำให้ผู้วิจัยสามารถเข้าใจการโต้ตอบและการเปลี่ยนแปลงของโมเลกุลได้ลึกซึ้งยิ่งขึ้น นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์แบบ deuterated เพื่อช่วยพัฒนายาที่มีความเสถียรภาพและประสิทธิภาพสูงขึ้น