Isoxazol-5-ylmethanol มีการใช้งานหลักในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ โครงสร้างของมันมักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาต้านจุลชีพและยาต้านเชื้อรา เนื่องจากวงแหวนไอซ็อกซาซอลมีความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร สนับสนุนการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช ความหลากหลายของสารนี้ยังขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ซึ่งใช้ในการเตรียมโพลิเมอร์และสารเคลือบพิเศษ