ไอโซซาโซลเป็นสารเคมีที่มีการใช้งานในหลายอุตสาหกรรม โดยเฉพาะในด้านการเกษตรและเภสัชกรรม ในด้านการเกษตร ไอโซซาโซลใช้เป็นส่วนประกอบสำคัญในการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและเชื้อรา ช่วยป้องกันและควบคุมโรคพืชที่เกิดจากเชื้อราได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ ยังมีการนำไอโซซาโซลมาใช้ในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม เช่น ยาต้านจุลชีพและยาต้านการอักเสบ เนื่องจากโครงสร้างของไอโซซาโซลมีความเสถียรและสามารถปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของยาได้ การใช้งานเหล่านี้ทำให้ไอโซซาโซลเป็นสารที่มีความสำคัญในวงการวิทยาศาสตร์และอุตสาหกรรม