PF-06651600 ถูกใช้หลักในการรักษาโรค autoimmune เนื่องจากความสามารถในการยับยั้ง JAK3 อย่างเลือกสรร ซึ่งเป็นเอนไซม์หลักที่เกี่ยวข้องกับการส่งสัญญาณในเซลล์ภูมิคุ้มกัน สารนี้แสดงศักยภาพในโรคต่าง ๆ เช่น rheumatoid arthritis, alopecia areata และ inflammatory bowel disease โดยการปรับการตอบสนองของภูมิคุ้มกันและลดการอักเสบ ความจำเพาะต่อ JAK3 ช่วยลดผลข้างเคียงนอกเป้าหมาย ทำให้เป็นตัวเลือกที่ปลอดภัยกว่ายับยั้ง JAK ที่กว้างขวาง การทดลองทางคลินิกแสดงให้เห็นประสิทธิภาพในการส่งเสริมการงอกของเส้นผมในผู้ป่วย alopecia และปรับปรุงอาการในโรค autoimmune ซึ่งเน้นศักยภาพในฐานะยาเฉพาะที่