4-Methoxy-2,4-dioxobutanoic acid ถูกใช้หลักๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตเภสัชภัณฑ์หลากหลายชนิด โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารประกอบที่มีคุณสมบัติทางรักษา เช่น สารต้านการอักเสบและสารต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีละเอียดและวัสดุพิเศษ ซึ่ง reactivity ของมันมีบทบาทสำคัญในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ในงานวิจัย สารประกอบนี้มักถูกใช้ในการศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ๆ การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปสู่สาขาเคมีเกษตร โดยมีส่วนช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชชนิดใหม่