3-Methyl-4-nonanone ถูกนำมาใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมรสชาติและกลิ่นหอม โดยให้กลิ่นหอมแบบผลไม้ ผสมเขียวเล็กน้อย และขี้ผึ้ง ทำให้เหมาะสำหรับการเสริมโปรไฟล์กลิ่นในน้ำหอม เครื่องสำอาง และผลิตภัณฑ์ดูแลส่วนบุคคล นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อผลิตสารประกอบเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น และอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนาสำหรับศึกษาการตอบสนองทางกลิ่นและเคมีรสชาติ