ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสร้างโครงสร้างของสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลชีพหรือสารต้านอักเสบ นิยมใช้ในขั้นตอนที่ต้องการป้องกันหมู่อะมิโนชั่วคราวในปฏิกิริยาเคมี เนื่องจากกลุ่ม tert-butyl carbamate (Boc) สามารถป้องกันหมู่ -NH2 ได้อย่างมีประสิทธิภาพและถอดออกได้ง่ายภายหลังโดยใช้กรด ทำให้ควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะจุดได้ดี เหมาะสำหรับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนหลายขั้นตอน