IRAK4-IN-6 ใช้หลักในการวิจัยทางชีวการแพทย์ โดยเฉพาะการศึกษาโรคอักเสบและมะเร็ง การประยุกต์ใช้มุ่งเน้นการยับยั้งเอนไซม์ kinase IRAK4 ซึ่งมีบทบาทสำคัญในเส้นทางการส่งสัญญาณภูมิคุ้มกัน เช่น TLR/IL-1R pathway สารนี้ช่วยให้นักวิจัยเข้าใจกลไกพื้นฐานของโรคภูมิต้านตนเอง การอักเสบเรื้อรัง และมะเร็งบางชนิด นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัย preclinical เพื่อประเมินศักยภาพของการยับยั้ง IRAK4 ในฐานะกลยุทธ์การรักษา ให้ข้อมูลเชิงลึกสำหรับการพัฒนายาโรคต่าง ๆ เช่น โรคข้ออักเสบรูมาตอยด์ โรคลูปัส และมะเร็ง myeloid malignancies IRAK4-IN-6 ยังทำหน้าที่เป็นสารตัวอย่าง (tool compound) ใน high-throughput screening assays เพื่อค้นหาและปรับปรุงตัวยับยั้ง IRAK4 ชนิดใหม่