ใช้ในระบบส่งยาอย่างแม่นยำ เนื่องจากมีคุณสมบัติแม่เหล็ก จึงสามารถควบคุมทิศทางการเคลื่อนที่ของไมโครสเฟียร์โดยใช้สนามแม่เหล็กภายนอก ทำให้ส่งยาไปยังตำแหน่งเป้าหมายในร่างกายได้อย่างมีประสิทธิภาพ เช่น ใช้ในการรักษามะเร็ง โดยลดผลข้างเคียงต่อเซลล์ปกติ

นิยมใช้ในการแยกสารชีวโมเลกุล เช่น การแยกดีเอ็นเอ โปรตีน หรือเซลล์จากตัวอย่างชีวภาพ เนื่องจากพื้นผิวสามารถปรับแต่งให้จับกับโมเลกุลเฉพาะได้ รวมถึงการตรึงเอนไซม์และการวินิจฉัย

เหมาะสำหรับใช้ในระบบเร่งปฏิกิริยาเคมี (catalysis) โดยทำหน้าที่เป็นตัวพาของตัวเร่งปฏิกิริยา ซึ่งสามารถแยกและนำกลับมาใช้ใหม่ได้ง่ายด้วยแรงดึงดูดแม่เหล็ก

นำไปใช้ในงานบำบัดน้ำเสีย เช่น การดูดซับโลหะหนักหรือสารอินทรีย์พิษ และสามารถแยกออกจากน้ำได้อย่างรวดเร็วหลังการบำบัด โดยไม่ต้องผ่านขั้นตอนการกรองหรือเหวี่ยง

นำไปใช้ในระบบปล่อยสารควบคุมในเกษตรกรรม เพื่อส่งสารอาหารหรือยาฆ่าแมลงอย่างต่อเนื่องและเฉพาะที่

มีศักยภาพในการใช้เป็นวัสดุในการถ่ายภาพทางการแพทย์ เช่น การถ่ายภาพด้วยคลื่นแม่เหล็กไฟฟ้า (MRI) เนื่องจากคุณสมบัติแม่เหล็กที่ช่วยเพิ่มความคมชัดของภาพ

คุณสมบัติ monodispersity ช่วยให้มีประสิทธิภาพสม่ำเสมอในอุปกรณ์ microfluidic และเป็นมาตรฐานสอบเทียบในเครื่องวิเคราะห์