3-Maleimidopropiohydrazide Trifluoroacetate ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีชีวคอนจูเกต โดยทำหน้าที่เป็นสารเคมีหลักสำหรับการเชื่อมโยงโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีนหรือเปปไทด์ กับสารอื่นๆ เช่น ยา สี หรือพื้นผิวแข็ง กลุ่ม maleimide ของมันทำปฏิกิริยาเลือกสรรกับกลุ่ม thiol ภายใต้สภาวะอ่อนโยน ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างพันธะ thioether ที่เสถียร คุณสมบัตินี้มีคุณค่าอย่างยิ่งใน antibody-drug conjugates (ADCs) ซึ่งช่วยในการติดยา cytotoxic กับแอนติบอดีสำหรับการบำบัดมะเร็งแบบกำหนดเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนา biosensors และเครื่องมือวินิจฉัย ซึ่งช่วยในการยึดติดโมเลกุลชีวภาพลงบนพื้นผิวอย่างแม่นยำ กลุ่ม hydrazide ของมันยังช่วยในการคอนจูเกตกับกลุ่ม aldehyde หรือ ketone ขยายประโยชน์ใช้ในกลยุทธ์ชีวคอนจูเกตต่างๆ ทำให้เป็นสารสำคัญในงานวิจัยทางชีวเคมีและอณูชีววิทยา เช่น การสร้างสารคอนจูเกตสำหรับการวินิจฉัยโรค การพัฒนายาเป้าหมายเฉพาะ การสร้างวัคซีน และการปรับเปลี่ยนพื้นผิวของอนุภาคนาโนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการส่งยา