คลอไรด์รูบิเดียมใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางวิทยาศาสตร์ โดยเฉพาะในสาขาชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล โดยทำหน้าที่เป็นแหล่งของไอออนรูบิเดียมในการทดลองศึกษากลไกการขนส่งไอออนในเซลล์และเยื่อหุ้มเซลล์ นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมแก้วและเซรามิกพิเศษ ซึ่งช่วยเสริมคุณสมบัติทางแสงบางประการ ในทางการแพทย์ คลอไรด์รูบิเดียมได้รับการสำรวจสำหรับการใช้ใน positron emission tomography (PET) scanning โดยรูบิเดียม-82 ซึ่งเป็นไอโซโทปกัมมันตรังสี สามารถทำหน้าที่เป็น tracer สำหรับการไหลเวียนของเลือดในหัวใจ นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการผลิตตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับการสังเคราะห์สารอินทรีย์ และในการผลิตส่วนประกอบอิเล็กทรอนิกส์บางประเภท