2-Fluoro-5-methylanisole ใช้หลักๆ ในอุตสาหกรรมสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถนำกลุ่มฟลูออรีนและเมทอกซี่เข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย เพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียร ในอุตสาหกรรมยา มักใช้ในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากความสามารถในการปรับการโต้ตอบของตัวรับ นอกจากนี้ ยังประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง ซึ่งคุณสมบัติทางเคมีช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความเลือกสรรของผลิตภัณฑ์สุดท้าย บทบาทในงานวิจัยและพัฒนายังสำคัญ โดยเฉพาะในการศึกษาสารประกอบอะโรมาติกฟลูออรีนและผลกระทบต่อระบบชีวภาพ