ไอโอไดด์ไตรเมทิลซัลโฟเนียมใช้หลักly เป็นสารเมทิลเรทติ้ง (methylating agent) ในการสังเคราะห์อินทรีย์ เพื่อถ่ายโอนหมู่เมทิลไปยังสารตั้งต้นต่าง ๆ มีการนำไปใช้ในการเตรียมยา โดยใช้ในการเมทิลเรตเอมีน แอลกอฮอล์ และนิวคลีโอไฟล์อื่น ๆ เพื่อเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือความเสถียรของสารประกอบ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีพิเศษ รวมถึงสีย้อมและสารเคมีเกษตร ที่ต้องการการเมทิลเรทอย่างแม่นยำ บทบาทในเคมีโพลิเมอร์ก็สำคัญ โดยช่วยปรับเปลี่ยนโพลิเมอร์เพื่อให้ได้สมบัติที่ต้องการ ประสิทธิภาพของสารประกอบในการเกิดปฏิกิริยาเมทิลเรททำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าในการวิจัยและกระบวนการอุตสาหกรรม