ใช้เป็นสารตัวนำเป้าหมายไปยังไมโตคอนเดรียในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา การประยุกต์ใช้หลักคือการส่งโมเลกุลชีวภาพไปยังไมโตคอนเดรียโดยเฉพาะ เนื่องจากคุณสมบัติ lipophilic cationic ของกลุ่ม triphenylphosphonium ซึ่งสามารถผ่านเยื่อไขมันได้ง่ายและสะสมในเมทริกซ์ไมโตคอนเดรียที่มีประจุลบ สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวเชื่อมหรือสารคอนจูเกต โดยเฉพาะในการพัฒนา antioxidants ยา หรือ probes ที่กำหนดเป้าหมายไปยังไมโตคอนเดรีย ช่วยเพิ่มการดูดซึมในเซลล์และการ localization ใน subcellular ทำให้มีคุณค่าในงานศึกษาที่เกี่ยวข้องกับ oxidative stress ภาวะไมโตคอนเดรียทำงานผิดปกติ และโรคเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์ยาใหม่ที่การส่งยาไปยังไมโตคอนเดรียแบบเลือกสรรช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงนอกเป้าหมาย