(2S,5S)-2,5-Dimethylmorpholine hydrochloride เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางยา โดยเฉพาะในขั้นตอนของการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนและมีโครงสร้างเฉพาะ สารนี้มักถูกนำมาใช้เป็นตัวกลางหรือรีเอเจนต์ในการผลิตสารตั้งต้นสำหรับยาชนิดต่าง ๆ เช่น ยาต้านไวรัสหรือยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาท นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการศึกษาวิจัยทางเคมีเพื่อพัฒนายาใหม่ ๆ เนื่องจากโครงสร้างของมันช่วยให้เกิดการปรับเปลี่ยนทางเคมีได้ง่าย และมีความเสถียรสูง