trans-4-Morpholinocyclohexanol ถูกใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งวงแหวน morpholine และกลุ่ม cyclohexanol ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายในเคมีอินทรีย์ มักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังระบบประสาทส่วนกลาง โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบที่มีศักยภาพเป็นยาแก้ประสาทหลอนหรือยาแก้ปวด นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตลิแกนด์สำหรับการศึกษา receptor ช่วยในการสำรวจเส้นทางชีวภาพและการค้นพบยา การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการสังเคราะห์สารเคมีละเอียดและวัสดุพิเศษที่ใช้ในงานวิจัยและกระบวนการอุตสาหกรรม