ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา เป็นตัวตั้งต้นหรือตัวกลางในการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่มีความเฉพาะเจาะจงสูง เช่น สารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพหรือยับยั้งเอนไซม์ เนื่องจากมีหมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ซึ่งทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งที่ต้องการได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เหมาะสำหรับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียว (stepwise synthesis) โดยเฉพาะในเปปไทด์หรือสารประกอบเฮเทอโรไซคลิก นอกจากนี้ โครงสร้างโมเลกุลที่มีวงโมเลกุลคล้ายโมร์ฟอลีนช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายในตัวทำละลายอินทรีย์และอาจมีผลต่อการออกฤทธิ์ของสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม