6-Methylmorpholine-2-carboxylic acid ถูกนำมาใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเพื่อเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอื่นๆ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ สามารถใช้เป็นตัวกลางในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ซึ่งมีประโยชน์ในด้านเภสัชวิทยาและการวิจัยทางเคมี นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการพัฒนาสารช่วยปรับปรุงกระบวนการทางเคมีหรือเป็นส่วนประกอบในสารเคมีเฉพาะทาง