Ethyl 3-Morpholinecarboxylate ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น ยาที่กำหนดเป้าหมายโรคทางระบบประสาทหรือยาต้านจุลินทรีย์ โครงสร้างวงแหวนมอร์โฟลีนมีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีการละลายน้ำและ bioavailability ที่ดีขึ้น นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์โพลิเมอร์และสารเคลือบ ซึ่งช่วยปรับปรุงคุณสมบัติวัสดุ เช่น ความยืดหยุ่นและความทนทาน ในงานวิจัย ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับการออกแบบสารเคมีใหม่ในเคมียารักษาและการค้นพบยา