2-(Difluoromethoxy)naphthalene ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตยาและสารเคมีเกษตร กลุ่ม difluoromethoxy ของมันช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพของโมเลกุล ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายาที่มีประสิทธิภาพและความเสถียรที่ดีขึ้น นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับสร้างโพลิเมอร์และสารเคลือบขั้นสูงที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น ทนต่อการย่อยสลายและความทนทานที่เพิ่มขึ้น การประยุกต์ใช้ในงานวิจัยยังขยายไปถึงการศึกษาพฤติกรรมของสารประกอบฟลูออรีนในปฏิกิริยาเคมีต่างๆ