1-Bromo-2,6-naphthyridine ถูกนำมาใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการพัฒนาโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น อะตอมโบรมีนของมันทำหน้าที่เป็นจุดปฏิกิริยาที่ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ต่าง ๆ เช่น Suzuki, Sonogashira หรือ Buchwald-Hartwig ซึ่งจำเป็นสำหรับการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ สารเคมีเกษตร และวัสดุ

ในการวิจัยเภสัชกรรม สารประกอบนี้มักถูกนำมาใช้ในการสร้างอนุพันธ์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพที่เป็นไปได้ โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังมะเร็ง การอักเสบ หรือโรคติดเชื้อ โครงสร้างแกน naphthyridine ของมันเป็นโครงสร้างที่มีคุณค่าในเคมียารักษาเนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพ เช่น เอนไซม์หรือตัวรับ

นอกจากนี้ 1-Bromo-2,6-naphthyridine ยังพบการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยใช้ในการสังเคราะห์เซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ ไดโอดแสงสว่าง (LEDs) หรือวัสดุอิเล็กทรอนิกส์อื่น ๆ การรวมเข้าในระบบคอนจูเกตสามารถเสริมสร้างคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์ของวัสดุเหล่านี้ ทำให้มีประโยชน์ในการออกแบบอุปกรณ์ออปโตอิเล็กทรอนิกส์ขั้นสูง

โดยรวมแล้ว ความสามารถในการทำปฏิกิริยาและคุณสมบัติโครงสร้างทำให้มันเป็นสารกลางที่มีคุณค่าในทั้งการวิจัยเคมีและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม