2,5-Dichloro-1,8-naphthyridine ถูกนำมาใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่างๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม โครงสร้างของสารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่เล็งเป้าไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ เช่น สารต้านไวรัสและสารต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการผลิตสารเคมีเกษตร เช่น ยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เพื่อช่วยปกป้องพืชผลจากศัตรูพืชและโรคภัย โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของสารนี้ยังทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีประโยชน์ในการวิจัยและพัฒนาวัสดุใหม่ โดยเฉพาะในสาขาอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์และโฟโตโวลตาอิก ซึ่งสามารถใช้เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพของอุปกรณ์ที่ไวต่อแสง