3-Bromo-1,8-naphthyridine ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในวงการเคมีอินทรีย์และเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ มันมักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้นผ่านปฏิกิริยาต่างๆ เช่น ปฏิกิริยาคัปปลิง (coupling reactions) และการแทนที่ด้วยนิวคลีโอไฟล์ (nucleophilic substitution) นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในการพัฒนายาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ เนื่องจากโครงสร้างของมันมีความสามารถในการจับกับเป้าหมายทางชีวภาพได้อย่างมีประสิทธิภาพ