ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการทางจิต ยาคลายกังวล หรือยากระตุ้นประสาท โครงสร้างพิเพอราซีนที่มีการแทนที่ด้วยหมู่ไดฟลูออโรเอทิลช่วยเพิ่มความสามารถในการข้ามเยื่อหุ้มสมองและปรับปรุงเสถียรภาพทางเคมีของโมเลกุล ทำให้เหมาะสมสำหรับการพัฒนายาที่ต้องการออกฤทธิ์ในสมอง นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวทำหน้าที่เป็นลิงเกอร์ (linker) หรือสไปเซอร์ (spacer) ในสารประกอบแบบไบฟังก์ชันแนลเพื่อเชื่อมต่อหน่วยฟังก์ชันต่าง ๆ ในการออกแบบโมเลกุลยาใหม่