โปรคโตลินเป็นเปปไทด์ประสาท (neuropeptide) ที่มีบทบาทสำคัญในการควบคุมการหดตัวของกล้ามเนื้อในสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลัง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในแมลง มันถูกใช้อย่างกว้างขวางในการวิจัยเพื่อศึกษาระบบประสาทและกล้ามเนื้อของสิ่งมีชีวิตเหล่านี้ โดยให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับวิธีที่เปปไทด์ประสาทควบคุมกิจกรรมของกล้ามเนื้อ ในด้านเอ็นโทมอลอจี โปรคโตลินถูกนำมาใช้ในการตรวจสอบกลไกทางสรีรวิทยาของการเคลื่อนไหว การกินอาหาร และพฤติกรรมอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับกล้ามเนื้อในแมลง นอกจากนี้ ยังเป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการศึกษาทางเภสัชวิทยาเพื่อสำรวจเป้าหมายที่เป็นไปได้สำหรับการควบคุมศัตรูพืช เนื่องจากการรบกวนการส่งสัญญาณของโปรคโตลินสามารถขัดขวางการทำงานที่จำเป็นในแมลง การประยุกต์ใช้ของมันยังขยายไปสู่ชีววิทยาประสาทเชิงเปรียบเทียบ ซึ่งช่วยในการทำความเข้าใจวิวัฒนาการของหน้าที่ของเปปไทด์ประสาทข้ามสายพันธุ์ต่างๆ