ใช้เป็นสารเคมีกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาที่มีฟลูออรีน (APIs) ซึ่งกลุ่มไนไตรล์และเมทอกซีช่วยอำนวยการโต้ตอบการจับเฉพาะ การแทนที่ด้วยไดฟลูออโรช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ในยาที่เป็นผู้สมัคร นิยมใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งไคเนสและตัวยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) เนื่องจากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และสเตอร์ริกที่เหมาะสม นอกจากนี้ยังใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรสำหรับการสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา โดยอะตอมฟลูออรีนช่วยปรับปรุง bioavailability และความคงทนต่อสิ่งแวดล้อม เหมาะสำหรับใช้ในสูตรของเหลวคริสตัลสำหรับเทคโนโลยีแสดงผล ซึ่งมีส่วนช่วยในพฤติกรรมเมโซเจนิกและความเสถียรทางความร้อน