ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาที่ใช้งานได้ (APIs) ที่ต้องการโครงสร้างพิเพอริดีนแบบ chiral กลุ่มฟังก์ชันเอมีนที่ได้รับการป้องกันและไซยาไนด์ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการค้นพบยา ใช้กันทั่วไปในการผลิตยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) รวมถึงยาต้านอาการซึมเศร้าและยาต้านจิตเภทบางชนิด กลุ่ม Boc ที่ป้องกันช่วยให้สามารถถอดการป้องกันได้อย่างควบคุมในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน เพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์สุดท้ายที่มีความบริสุทธิ์สูงและผลผลิตดี