2-Fluoro-3,6-dimethylbenzonitrile เป็นสารเคมีที่ใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเคมีเกษตร โดยมักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือสารกลางในการสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาและสารกำจัดศัตรูพืช นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ ๆ เนื่องจากโครงสร้างโมเลกุลที่มีหมู่ฟลูออรีนและไซยาโน ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของสารที่สังเคราะห์ขึ้น