AA-dUTP sodium salt ใช้อย่างแพร่หลายในชีววิทยาโมเลกุลสำหรับการติดฉลากโปรบดีเอ็นเอ (DNA probes) โดยจะถูกนำเข้าไปในสายดีเอ็นเอระหว่างปฏิกิริยาเอนไซม์ เช่น PCR หรือ nick translation เพื่อนำเข้าสนิวคลีโอไทด์ที่ถูกดัดแปลง การดัดแปลงนี้ช่วยให้สามารถติดตั้งตัวบ่งชี้ที่ตรวจจับได้ เช่น สีย้อมเรืองแสงหรือไบโอติน ซึ่งช่วยให้เกิดการประยุกต์ใช้ใน fluorescence in situ hybridization (FISH) และการวิเคราะห์ไมโครอาร์เรย์ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับการถอดรหัสลำดับดีเอ็นเอและการตรวจจับ โดยให้เครื่องมือที่หลากหลายสำหรับการแสดงภาพและวิเคราะห์กรดนิวคลีอิกในงานวิจัยและการวินิจฉัย