5’-Fluorescein phosphoramidite ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์ oligonucleotide ที่ติดฉลากด้วยฟลูออเรสเซนต์สำหรับงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลและพันธุศาสตร์ มันช่วยให้สามารถนำสีฟลูออเรสเซนต์เข้าไปในลำดับ DNA หรือ RNA ซึ่งช่วยในการตรวจจับและการแสดงภาพในแอปพลิเคชันต่างๆ เช่น fluorescence in situ hybridization (FISH), PCR, และ gel electrophoresis. Oligonucleotide ที่ติดฉลากเหล่านี้เป็นเครื่องมือที่มีค่าในการศึกษาการแสดงออกของยีน, กลายพันธุ์ทางพันธุกรรม, และปฏิสัมพันธ์ของกรดนิวคลีอิก นอกจากนี้ ยังใช้ใน assays การวินิจฉัยและเทคโนโลยีการคัดกรองความสามารถสูงเพื่อติดตามและวิเคราะห์ลำดับกรดนิวคลีอิกด้วยความไวและความจำเพาะสูง