9-Methyl Adenine ใช้ในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษากลไกของเอนไซม์และปฏิกิริยาของกรดนิวคลีอิก โดยเฉพาะในการทำความเข้าใจบทบาทของอะดีนีนที่ถูกเมทิลเลตใน DNA และ RNA มันทำหน้าที่เป็นสารโมเดลสำหรับการตรวจสอบกระบวนการเมทิลเลชันและผลกระทบต่อการควบคุมทางพันธุกรรม นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์นิวคลีโอไซด์และนิวคลีโอไทด์ที่ถูกดัดแปลงสำหรับการประยุกต์ใช้ทาง درمانیและวินิจฉัย บทบาทของมันในการเลียนแบบเบสที่ถูกเมทิลเลตตามธรรมชาติช่วยในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปยังการดัดแปลงทางเอพิจีเนติก