6-Methoxypurine ถูกนำมาใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยาเพื่อศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และกระบวนการทางชีวภาพ เนื่องจากมีโครงสร้างคล้ายกับสารประกอบในธรรมชาติ เช่น พิวรีนเบส ที่พบใน DNA และ RNA จึงมักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือตัวยับยั้งในการทดลองเกี่ยวกับการสังเคราะห์นิวคลีโอไทด์ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเพื่อประเมินศักยภาพในการเป็นสารต้านมะเร็งหรือสารต้านไวรัส โดยมุ่งเน้นที่การยับยั้งการทำงานของเอนไซม์สำคัญที่เกี่ยวข้องกับการแบ่งเซลล์และการแพร่พันธุ์ของไวรัส