โซเดียมซอลต์ของไซแธนีนถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะสารตั้งต้นสำหรับศึกษากิจกรรมของเอนไซม์ เช่น ไซแธนีนออกซิเดส ซึ่งมีบทบาทในกระบวนการเมแทบอลิซึมของพิวรีน นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ยาต่างๆ โดยเฉพาะยาที่รักษาอาการหอบหืดและโรคปอดอุดกั้นเรื้อรัง (COPD) เนื่องจากมีคุณสมบัติเป็นยขยายหลอดลม นอกจากนี้ยังเป็นสารกลางสำคัญในการผลิตคาเฟอีนและเมทิลไซแธนีนอื่นๆ ซึ่งมีความสำคัญในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องดื่ม บทบาทในการเสริมประสิทธิภาพทางกีฬาและลดความเหนื่อยล้าก็ได้รับการสำรวจในวงการวิทยาศาสตร์การกีฬา