3'-Azido-3'-deoxy-5-methylcytidine เป็นสารสำคัญที่ใช้ในการวิจัยด้านยาต้านไวรัส โดยเฉพาะในการพัฒนานิวคลีโอไซด์อะนาล็อก สารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยารักษาที่มีศักยภาพในการต่อสู้กับการติดเชื้อไวรัส เช่น HIV และตับอักเสบ กลุ่มอะซิโดในโครงสร้างช่วยให้สามารถปรับแต่งได้เฉพาะเจาะจง ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบโปรดรักที่เพิ่มการดูดซึมทางชีวภาพและความจำเพาะต่อเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาทางชีวเคมีเพื่อตรวจสอบกลไกการจำลองตัวของไวรัสและการยับยั้ง ซึ่งช่วยในการค้นพบกลยุทธ์ยาต้านไวรัสใหม่ การรวมเข้าในลำดับกรดนิวคลีอิกยังอำนวยความสะดวกในการวิจัยด้านการกลายพันธุ์และปฏิสัมพันธ์ DNA/RNA