5'-O-(4,4'-Dimethoxytrityl)-inosine ใช้หลักในการสังเคราะห์ oligonucleotides โดยทำหน้าที่เป็นตัวกลางนิวคลีโอไซด์ที่ได้รับการป้องกัน สารนี้มีบทบาทสำคัญในการผลิตลำดับ RNA และ DNA ที่ถูกปรับแต่ง โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเคมีกรดนิวคลีอิก กลุ่ม dimethoxytrityl (DMT) ให้การป้องกันกลุ่ม 5'-hydroxyl ในระหว่างการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็ง เพื่อให้มั่นใจในการประกอบโซ่ nucleotide ที่แม่นยำและควบคุมได้ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนา oligonucleotides สำหรับการบำบัด เช่น ยา antisense และ siRNA ซึ่งต้องการความบริสุทธิ์และความจำเพาะสูง นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาอนาล็อกนิวคลีโอไซด์สำหรับการประยุกต์ใช้ในการต้านไวรัสและต้านมะเร็ง